בחלקה הדרום מערבי של שכונת גליל ים החדשה )בסמוך לבית הקברות(, פועל כיום מכון לטיהור שפכים )מט״ש(.
מטרת המכון לטיהור השפכים היא הוצאת חומרים מזהמים, כימיקלים וחיידקים המסוכנים לבני אדם, ממי הביוב באמצעות תהליכים שונים. בשנת 2017 החלו משרד האוצר, רשות מקרקעי ישראל, רשות המים והמשרד להגנת הסביבה לקדם תוכנית לפינוי מכון טיהור השפכים וחיבורו לשפד"ן )מכון טיהור שפכי גוש דן(. תוכנית זו אפשרה בין השאר את הפקדת התוכניות לבנייתם של ה״מגה״ פרוייקטים בצידה המערבי של השכונה, ואת תכנון פרוייקט ״הרצליה בין ערים״ העתידי. עיריית הרצליה אימצה בחום את תוכנית פינוי המכון, מאחר שהוא מהווה מטרד ריח עבור השכונות הסמוכות, וכי קיים חשש שהמתקן לא יעמוד בכמות השפכים המוזרמת אליו, עקב הגידול באוכלוסיית גליל ים החדשה שצפוי להתעצם בשנים הקרובות.
על פי הסיכומים, המדינה היתה צריכה להשלים את פינויו של המכון וחיבורו לשפד״ן עד סוף 2020. מאחר שהפינוי טרם קרה, החליטה עיריית הרצליה, כפתרון ביניים, להרחיב את המכון, וזאת על מנת שיעמוד בעומסי השפכים המוזרמים אליו. מהלך זה נתקל בהתנגדות של ועד שכונת גליל ים החדשה, אשר פועל בימים אלו על מנת לסכל החלטה זו, בין השאר מחשש שתשמש ״תירוץ״ עבור המדינה להמשיך ולעכב את תוכנית הפינוי של המכון. עם זאת, השבוע נוכחנו לדעת שהמדינה כן נראה שפועלת לפינויו של המכון, כאשר הוועדה לקידום מתחמים מועדפים לדיור )הותמ"ל( אישרה את תוכנית "הרצליה בין ערים", שבמסגרתה יקומו 1,230 יחידות דיור בין גליל ים לרמת השרון, בין השאר בשטח בו קיים היום המכון לטיהור השפכים. אנו מקווים שהפינוי יחל בקרוב.